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重疊延伸PCR

2019.3.27

重疊延伸PCR技術(shù)主要用于獲得其它依靠限制性?xún)?nèi)切酶消化方法難以得到的產(chǎn)物。可用于:(1)基因的定點(diǎn)突變;(2)融合基因的構(gòu)建;(3)長(zhǎng)片段基因的合成;(4)基因敲除以及目的基因的擴(kuò)增

實(shí)驗(yàn)方法原理重疊延伸PCR技術(shù)(gene splicing by overlap extension PCR,簡(jiǎn)稱(chēng)SOE PCR)由于采用具有互補(bǔ)末端的引物,使PCR產(chǎn)物形成了重疊鏈,從而在隨后的擴(kuò)增反應(yīng)中通過(guò)重疊鏈的延伸,將不同來(lái)源的擴(kuò)增片段重疊拼接起來(lái)。
實(shí)驗(yàn)材料

基因樣品

試劑、試劑盒

PCR擴(kuò)增酶擴(kuò)增酶BufferdNTP引物

儀器、耗材

PCR儀

實(shí)驗(yàn)步驟

1. ?以引物a/b進(jìn)行pcr1。


2. ?以引物c/d進(jìn)行pcr2。


3. ?引物b/c中引入了需要的限制性位點(diǎn)。


4. ?混合二者pcr產(chǎn)物,混合以前最好回收一下。


5. ?進(jìn)行pcr延伸反應(yīng),只有右面這個(gè)可以延伸。


6. ?以延伸反應(yīng)的產(chǎn)物為模板,以a/d為引物進(jìn)行pcr。


7. ?產(chǎn)物即為所需最終產(chǎn)物。

收起?
注意事項(xiàng)

盡管擴(kuò)增序列的殘留污染大部分是假陽(yáng)性反應(yīng)的原因,樣品間的交叉污染也是原因之一。因此,不僅要在進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)是謹(jǐn)慎認(rèn)真,在樣品的收集、抽提和擴(kuò)增的所有環(huán)節(jié)都應(yīng)該注意:


1. 戴一次性手套,若不小心濺上反應(yīng)液,立即更換手套;


2. 使用一次性吸頭,嚴(yán)禁與PCR產(chǎn)物分析室的吸頭混用,吸頭不要長(zhǎng)時(shí)間暴露于空氣中,避免氣溶膠的污染;


3. 避免反應(yīng)液飛濺,打開(kāi)反應(yīng)管時(shí)為避免此種情況,開(kāi)蓋前稍離心收集液體于管底。若不小心濺到手套或桌面上,應(yīng)立刻更換手套并用稀酸擦拭桌面;


4. 操作多份樣品時(shí),制備反應(yīng)混合液,先將dNTP、緩沖液、引物和酶混合好,然后分裝,這樣即可以減少操作,避免污染,又可以增加反應(yīng)的精確度;


5. 最后加入反應(yīng)模板,加入后蓋緊反應(yīng)管;


6. 操作時(shí)設(shè)立陰陽(yáng)性對(duì)照和空白對(duì)照,即可驗(yàn)證PCR反應(yīng)的可靠性,又可以協(xié)助判斷擴(kuò)增系統(tǒng)的可信性;


7. 盡可能用可替換或可高壓處理的加樣器,由于加樣器最容易受產(chǎn)物氣溶膠或標(biāo)本DNA的污染,最好使用可替換或高壓處理的加樣器。如沒(méi)有這種特殊的加樣器,至少PCR操作過(guò)程中加樣器應(yīng)該專(zhuān)用,不能交叉使用,尤其是PCR產(chǎn)物分析所用加樣器不能拿到其它兩個(gè)區(qū);


8. 重復(fù)實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證結(jié)果,慎下結(jié)論。?


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