質(zhì)粒載體的載體大小的介紹
大的質(zhì)粒（大于15kb）不會很好轉(zhuǎn)化而且DNA產(chǎn)量通常很低。在設計實驗時要考慮到加入插入片段的最終載體大小，盡量用更小的載體。
兼容性
當多于一個質(zhì)粒載體必須同時存在于同一個細菌細胞中，這兩個質(zhì)粒的復制子必須是兼容的。當他們不能穩(wěn)定地共存時，則認為這兩個質(zhì)粒是不兼容的。
選擇/檢測插入片段：
為了鑒別質(zhì)粒中是否含有插入片段，對一些載體進行了工程改造，這樣產(chǎn)生的多位點接頭的分離會引起可見的表型。例如：lacZ基因的應用（多位點接頭的分離會引用白細胞的生長而抑制藍細胞的生長，如pU19）和cccdB基因（調(diào)控細胞死亡）的應用（分離會促進細胞存活）。
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